Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms