Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apex1P28352 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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