Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CftrP26361 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CftrP26361 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CftrP26361 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CftrP26361 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms