Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PparaP23204 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms