Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms