Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms