Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhoP15409 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhoP15409 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhoP15409 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhoP15409 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhoP15409 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhoP15409 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RhoP15409 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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