Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms