Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sub1P11031 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sub1P11031 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sub1P11031 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sub1P11031 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sub1P11031 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sub1P11031 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sub1P11031 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sub1P11031 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Sub1P11031 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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