Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms