Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Spta1P08032 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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