Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms