Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Dnajb6O54946 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms