Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DffaO54786 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DffaO54786 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DffaO54786 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DffaO54786 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DffaO54786 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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