Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms