Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Clk2O35491 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Clk2O35491 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Clk2O35491 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms