Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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