Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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