Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Speer4dL7N216 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4dL7N216 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms