Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms