Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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