Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms