Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms