Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr16A3KMN5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms