Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms