Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Scn3aA2ASI5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Scn3aA2ASI5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Scn3aA2ASI5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Scn3aA2ASI5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Scn3aA2ASI5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Scn3aA2ASI5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Scn3aA2ASI5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scn3aA2ASI5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scn3aA2ASI5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scn3aA2ASI5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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