Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms