Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo47A2A6H3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo47A2A6H3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms