Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbp2Q9Z0E6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp2Q9Z0E6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp2Q9Z0E6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms