Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fhl3Q9R059 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhl3Q9R059 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225 ms