Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AmfrQ9R049 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms