Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpd3Q9JJY3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpd3Q9JJY3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smpd3Q9JJY3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smpd3Q9JJY3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smpd3Q9JJY3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd3Q9JJY3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd3Q9JJY3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd3Q9JJY3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd3Q9JJY3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpd3Q9JJY3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms