Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESB3

Hrg, Histidine-rich glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrgQ9ESB3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrgQ9ESB3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HrgQ9ESB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HrgQ9ESB3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms