Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D8N1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D8N1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D8N1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D8N1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D8N1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D8N1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D8N1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8N1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8N1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8N1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms