Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gbe1Q9D6Y9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbe1Q9D6Y9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms