Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc94Q9D6J3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms