Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cmtm5Q9D6G9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtm5Q9D6G9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms