Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt20Q9D312 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms