Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp1b2Q9CQD4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp1b2Q9CQD4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms