Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RetnQ99P87 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RetnQ99P87 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms