Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC9

Pex6, Peroxisome assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex6Q99LC9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pex6Q99LC9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms