Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc49Q91YK0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc49Q91YK0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc49Q91YK0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc49Q91YK0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc49Q91YK0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc49Q91YK0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc49Q91YK0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms