Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csde1Q91W50 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csde1Q91W50 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms