Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colec12Q8K4Q8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colec12Q8K4Q8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms