Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc12Q8K2L8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc12Q8K2L8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms