Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc17Q8CE13 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc17Q8CE13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc17Q8CE13 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms