Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atad2Q8CDM1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atad2Q8CDM1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms