Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Nhlrc3Q8CCH2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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