Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppm1mQ8BU27 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppm1mQ8BU27 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppm1mQ8BU27 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppm1mQ8BU27 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppm1mQ8BU27 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppm1mQ8BU27 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppm1mQ8BU27 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppm1mQ8BU27 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppm1mQ8BU27 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms