Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PcgF3Q8BTQ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PcgF3Q8BTQ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PcgF3Q8BTQ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcgF3Q8BTQ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcgF3Q8BTQ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcgF3Q8BTQ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcgF3Q8BTQ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcgF3Q8BTQ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms